Právo užívat vlajku obci Vlachova Lhota udělil předseda Poslanecké sněmovny Parlamentu České republiky dne 22.1.2001. Současně obci udělil také právo užívat znak.
Číslo rozhodnutí: 79
Popis vlajky: List tvoří pět vodorovných pruhů, červený, bílý, modrý, bílý a červený v poměru 1:1:2:1:1. Z modrého pruhu uprostřed vyrůstají protilehlá trojúhelníková pole se základnou rovnou jedné pětině délky listu, dotýkající se vrcholy červených pruhů. Uprostřed modrého pruhu žlutá včela mezi dvěma položenými bílými vlčími udicemi. Poměr šířky k délce listu je 2:3.